Группа управления Института Северного Измерения (ГУ ИСИ) состоит из представителей университетов и научно-исследовательских институтов, входящих в СИ, и представителей партнёрств СИ. Основными задачами ГУ ИСИ являются следующие:
1. Продвижение ИСИ на национальных и международных конференциях
2. Создание и продвижение идей для научных исследований ИСИ.
3. Отслеживание и поддержка деятельности ИСИ.
ГУ ИСИ назначается на два года. Должность председателя периодически переходит от одной страны-партнёра СИ к другой.